หมู่เจดีย์ทรงเครื่องสลับคั่นด้วยวิหารกุฏิ (กุฏิพุทธองค์) ตั้งร่วมกันบนฐานไพทีด้านหลังอุโบสถ วัดอินทาราม ได้รับการบูรณะครั้งใหญ่สมัยท่านเจ้าคุณพระทักษิณคณิศรเป็นเจ้าอาวาส (พ.ศ. 2448-2484) ข้อมูลจารึกบนผนังวิหารน้อยทิศตะวันตกระบุข้อความว่า

“ข้าพเจ้าคุณนายขันทอง พระยาบริรักษ์จัตุรงค์และคุณหญิง ได้บริจาคเงินปฏิสังขรณ์วิหารหลังนี้ เป็นจำนวนเงิน ๑,๔๗๐ บาท เสร็จเมื่อเดือน ๑๐ แรม ๑๒ (?) ค่ำ วันที่ ๑๐ ตุลา ๒๔๘๓”

ส่วนวิหารอีก 3 หลังพบประวัติการซ่อมตามรูปแบบเดิมภายใต้การกำกับของกองหัตถศิลป์ กระทรวงศึกษาธิการ ระหว่าง พ.ศ. 2496-99 การวางผังอาคารและจิตรกรรมฝาผนังภายในวิหารกุฏิคู่นอกบ่งบอกว่าน่าจะเป็นงานออกแบบแต่แรกสร้างเขตพุทธาวาสขึ้นใหม่ภายใต้การอุปถัมภ์ของพระยาศรีสหเทพ (ศรีเพ็ง) ในสมัยรัชกาลที่ 3 หลักฐานจิตรกรรมฝาผนังวิหารกุฏิคู่นอกเขียนลายดอกไม้ร่วงเป็นดอกโบตั๋นสลับใบไม้แบบจีน สอดแทรกภาพสัตว์ ได้แก่ ค้างคาว ค้างคาวแดง นก แมลงปอ และผีเสื้อ แปลกตาจากแบบแผนลายดอกลอย และดอกไม้ร่วงโดยทั่วไป

กลางผนังเขียนภาพเครื่องตั้งโดยใช้ “กี๋ไม้ม้วนขนาดใหญ่” เป็นแกนกลางภาพเกือบเต็มพื้นที่ห้อง การเขียนภาพเครื่องตั้งขนาดใหญ่ดังกล่าวสัมพันธ์กับจิตรกรรมฝาผนังอุโบสถวัดภคินีนาถฯ ซึ่งรัชกาลที่ 3 ทรงโปรดเกล้าฯ ให้บูรณะขึ้นราว พ.ศ. 2374 และน่าจะเป็นแบบอย่างใหม่แก่งานจิตรกรรมฝาผนังในกลุ่มวัดที่ขุนนาง หรือคหบดีซ่อมสร้าง อาทิ อุโบสถวัดจันทาราม อุโบสถวัดนาคปรก และวิหารกุฏิวัดอินทารามแห่งนี้

จิตรกรรมดอกไม้ร่วงและภาพเครื่องตั้งบนกี๋ไม้ม้วนขนาดใหญ่ภายในวิหารกุฏิหลังริมสุดด้านทิศเหนือ ซึ่งมีรูปแบบการเขียนแนวเดียวกับจิตรกรรมวิหารกุฏิหลังริมสุดด้านทิศใ

จิตรกรรมดอกไม้ร่วงและภาพเครื่องตั้งบนกี๋ไม้ม้วนขนาดใหญ่ภายในวิหารกุฏิหลังริมสุดด้านทิศเหนือ ซึ่งมีรูปแบบการเขียนแนวเดียวกับจิตรกรรมวิหารกุฏิหลังริมสุดด้านทิศใ